由于脑脊液直接与脑组织接触，可直接反映脑组织的病理改变，故被视为理想的生物标志物来源。阿尔茨海默病痴呆期患者可出现特征性脑脊液表现：Aβ42降低、总tau和p-tau升高。脑脊液不仅可作为阿尔茨海默病痴呆期的诊断标志物，其特征性脑脊液变化还可用于预测阿尔茨海默病的发生。一项家族性阿尔茨海默病研究显示，家族性阿尔茨海默病基因携带者在出现临床症状前的15~20年即已出现脑脊液 Aβ42显著下降、总tau和p-tau升高，提示阿尔茨海默病临床前期就已存在与阿尔茨海默病痴呆期相似的脑脊液改变。

通常情况下，脑脊液是通过腰椎穿刺获得的。腰椎穿刺是临床上一项常规操作，穿刺的部位在脊柱第三、四腰椎间隙，操作前均进行局部麻醉。腰椎穿刺进行脑脊液检查是阿尔茨海默病重要的检查手段，对诊断、鉴别诊断和评价疾病进展程度有重要意义。只要医生操作得当，患者积极配合，一般情况下腰穿是安全无害的。